Hands-On Demonstrator Series: Napari-KICS
- Datum
- 27.10.2022
- Zeit
- 13:00 - 14:00
- Sprecher
- Arne Ludwig
- Sprache
- en
- Hauptthema
- Biologie
- Andere Themen
- Informatik
- Beschreibung
- Chromosome-scale genome assembly is affected by scaffolding errors and may yield incorrect chromosome sizes. Today, we present KICS, a semi-automated and cost-efficient approach for examining the validity of the assembly by estimating relative chromosome sizes from the respective karyotype images. The method employs threshold-based image segmentation and uses the extracted chromosome areas as proxies for the actual chromosome sizes. The suitability of the approach is confirmed by a strong correlation between area and DNA content evaluated on karyotype images of varied species and achieving a 6 Mb chromosome size error on a reference human karyotype dataset.
- Links
Letztmalig verändert: 17.10.2022, 10:17:40
Veranstaltungsort
TUD Andreas-Pfitzmann-Bau (Informatik) (Room: 1020
)Nöthnitzer Straße4601069Dresden
- Homepage
- https://navigator.tu-dresden.de/etplan/apb/00
Veranstalter
Center for Scalable Data Analytics and Artificial Intelligence (ScaDS.AI)Chemnitzer Straße46b, 2. OG01187Dresden
- Telefon
- +49 351 463-40900
- ScaDS.AI
- Homepage
- https://scads.ai
Scannen Sie diesen Code mit Ihrem Smartphone and bekommen Sie die Veranstaltung direkt in Ihren Kalender. Sollten Sie Probleme beim Scannen haben, vergrößern Sie den Code durch Klicken darauf.
Legende
- Ausgründung/Transfer
- Bauing., Architektur
- Biologie
- Chemie
- Elektro- u. Informationstechnik
- für Schüler:innen
- Gesellschaft, Philos., Erzieh.
- Informatik
- Jura
- Maschinenwesen
- Materialien
- Mathematik
- Medizin
- Physik
- Psychologie
- Sprache, Literatur und Kultur
- Umwelt
- Verkehr
- Weiterbildung
- Willkommen
- Wirtschaft